API

• Command-line (ome_zarr.cli)
  • config_logging()
  • create()
  • csv_to_labels()
  • download()
  • info()
  • main()
  • scale()
  • view()
• CSV (ome_zarr.csv)
  • csv_to_zarr()
  • dict_to_zarr()
  • parse_csv_value()
• Data (ome_zarr.data)
  • astronaut()
  • coins()
  • create_zarr()
  • make_circle()
  • rgb_to_5d()
• Format (ome_zarr.format)
  • CurrentFormat
  • Format
  • FormatV01
  • FormatV02
    • FormatV02.init_store()
  • FormatV03
  • FormatV04
    • FormatV04.validate_coordinate_transformations()
  • detect_format()
  • format_implementations()
• Input/output (ome_zarr.io)
  • ZarrLocation
    • ZarrLocation.basename()
    • ZarrLocation.create()
    • ZarrLocation.exists()
    • ZarrLocation.get_json()
    • ZarrLocation.load()
    • ZarrLocation.root_attrs
    • ZarrLocation.store
  • parse_url()
• Reader (ome_zarr.reader)
  • Label
    • Label.matches()
  • Labels
    • Labels.matches()
  • Multiscales
    • Multiscales.matches()
  • Node
    • Node.add()
    • Node.visible
  • OMERO
  • Plate
    • Plate.get_pyramid_lazy()
  • PlateLabels
    • PlateLabels.get_pyramid_lazy()
    • PlateLabels.get_tile_path()
  • Reader
  • Spec
  • Well
• Scale (ome_zarr.scale)
  • Scaler
    • Scaler.gaussian()
    • Scaler.laplacian()
    • Scaler.local_mean()
    • Scaler.methods()
    • Scaler.nearest()
    • Scaler.resize_image()
    • Scaler.scale()
    • Scaler.zoom()
• Utilities (ome_zarr.utils)
  • download()
  • info()
  • strip_common_prefix()
• Writer (ome_zarr.writer)
  • write_image()
  • write_label_metadata()
  • write_labels()
  • write_multiscale()
  • write_multiscale_labels()
  • write_multiscales_metadata()
  • write_plate_metadata()
  • write_well_metadata()